Krzysztof Krystowski jest Prezesem Związku Klastrów Polskich, ale również Prezesem Śląskiego Klastra Lotniczego. Od 2019 jest jednym z dziesięciu niezależnych ekspertów Komisji Europejskiej w grupie ds. klastrów. W 2020 roku został wybrany wiceprezesem European Clusters Alliance oraz jednym z pięciu przedstawicieli (reprezentacja przed Komisją Europejską) European Aerospace Cluster Partnership.

Krzysztof Krystowski w styczniu 2015 r. został powołany na stanowisko prezesa zarządu i dyrektora zarządzającego PZL – Świdnik, a od stycznia 2016 r. był wiceprezesem Finmeccanica Helicopter Division – funkcje te pełnił do końca 2018 roku. W latach 2012-2013 był prezesem zarządu Grupy Bumar, a później Polskiego Holdingu Obronnego. W latach 2006 – 2011 pracował jako menadżer w Grupie Avio – globalnej firmie przemysłu lotniczego. Był także członkiem Rady Głównej PKPP Lewiatan oraz Narodowej Rady Ekologicznej przy Prezydencie RP, jak również Rady Przemysłowo – Obronnej przy Ministrze Obrony Narodowej. W latach 2004 – 2006 był Przewodniczącym Rady Fundacji „Centrum Innowacji” FIRE zajmującej się pomocą małym i średnim przedsiębiorstwom innowacyjnym. W latach 2003 – 2006 pełnił funkcję wiceministra w Ministerstwie Gospodarki, Pracy i Polityki Społecznej (potem w Ministerstwie Gospodarki i Pracy). Odpowiadał wówczas za konkurencyjność i innowacyjność gospodarki, nadzór nad jednostkami badawczo-rozwojowymi oraz Urzędem Patentowym RP, jak również za restrukturyzację przemysłu obronnego i lotniczego oraz offset.